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東岱科學(xué)器材

來源:東岱科學(xué)器材日期:2018-06-04 14:31:00瀏覽次數(shù):


乳腺癌起源于乳腺上皮細胞,原因是乳腺上皮細胞發(fā)生基因改變,導(dǎo)致隨后組織穩(wěn)態(tài)喪失??茖W(xué)家們經(jīng)過大量研究將乳腺上皮細胞分為幾個不同的亞群,但依然無法完全了解上皮細胞異質(zhì)性和分化譜。


加州大學(xué)歐文分校(University of California, Irvine)的科學(xué)家,在最新一期Nature Communication上發(fā)表文章,采用單細胞mRNA測序(ScRNAseq)分析來自7個不同乳腺增生病人的25,790個人乳腺上皮細胞的轉(zhuǎn)錄組,使用無偏聚分析揭示了三種不同的上皮細胞群的存在,一種是基底細胞,另一種是導(dǎo)管腔上皮細胞,分為激素分泌型L1和激素反應(yīng)L2型細胞。


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文章作者從單細胞測序數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn),KRT8在L2型細胞中比L1性表達水平高。

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  為了闡述KRT8蛋白質(zhì)表達異質(zhì)性,作者選擇了ProteinSimple Milo單細胞western blot。Milo可將細胞分為三個亞群:陰性,低表達,高表達。并可以準(zhǔn)確計算各亞群細胞的百分比即數(shù)量。

L2 was also characterized by higher levels of KRT8 than L1

 To quantify protein expression in individual cells, we utilized a recently developed single-cell western blot application (ProteinSimple, Milo), which performs electrophoretic separation of the protein content of about 2000 cells per chip and subsequently probed with fluorescently labeled antibodies.

Applying single-cell western blotting to luminal and basal cells isolated by FACS identified three cell states, namely KRT8-negative, -low, and -high , which illustrates the usefulness of single cell Western blotting as a quantitative validation tool downstream of scRNAseq analyses.

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單細胞基因測序+Milo單細胞western blot組合,可以從基因水平和蛋白質(zhì)水平完整解析細胞異質(zhì)性,闡述腫瘤發(fā)生,干細胞發(fā)育等關(guān)鍵生命醫(yī)學(xué)問題。

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